Os conflitos éticos são uma parte inevitável do trabalho secreto. Os policiais são frequentemente obrigados a construir amizades e relacionamentos com suspeitos que acabarão por trair no tribunal. A constante necessidade de mudar de uma personalidade criminosa para a verdadeira identidade do oficial também pode romper ou prejudicar as relações familiares. Deixados sozinhos por períodos prolongados, os policiais podem se ver mais dispostos a cortar as barreiras éticas - especialmente se virem perspectivas de emprego melhores à frente.
Relacionamentos Traídos
Para policiais disfarçados, construir casos significa formar relacionamentos próximos com suspeitos que acabarão traindo. O ex-agente federal Billy Queen lutou contra essas realidades durante uma investigação de dois anos da gangue de motociclistas mongóis, "The Washington Post", divulgada em outubro de 2005. A rainha não tinha ilusões sobre a propensão dos mongóis à violência, embora gostasse de muitos deles pessoalmente.. O estresse de manipular essas emoções conflitantes forçou a Rainha a se aposentar do Departamento de Álcool, Tabaco, Armas de Fogo e Explosivos dos EUA, afirmou o jornal.
Riscos de Corrupção
Um dos mais antigos conflitos disfarçados é ter que se passar por criminosos sem cruzar a linha. O chefe da polícia nacional filipina, Jesus Verzosa, expressou essa justificativa ao proibir o uso de substâncias ilegais durante investigações de drogas, informou a rede ABS-CBN em fevereiro de 2009. A ordem do chefe seguiu relatos de que 221 de 25.134 policiais haviam falhado nos testes de drogas. Um escândalo semelhante abalou o distrito de South Brooklyn, em Nova York, onde quatro policiais foram presos e mais seis suspensos por informantes recompensadores com drogas, afirmou o "New York Times" em janeiro de 2008.
Problemas de identidade
Isolados da família e dos amigos, oficiais disfarçados lutam para equilibrar suas identidades reais e assumidas. O trabalho da rainha contra os mongóis forçou a realocação de sua ex-mulher e dois filhos, que não tinham ideia do que estava acontecendo, observou o "Washington Post". Oficiais britânicos também foram acusados de trocar sexo por informação. Um tribunal citou essas preocupações ao anular a condenação por assassinato de Colin Stagg, "The Guardian" relatou em janeiro de 2011. A decisão seguiu relata que uma policial disfarçada iniciou um relacionamento com Stagg para ganhar uma confissão.
Integridade perdida
Apesar de seus riscos e tensões, o trabalho secreto continua sendo uma proposta atraente para detetives e policiais que buscam uma carreira de longo prazo. Indo disfarçado em Nova York pode garantir uma promoção de detetive em 18 meses, em vez de três a cinco anos, afirma o "New York Times". Tais processos também podem criar uma mentalidade de corte de ponta que pode prejudicar a reputação de uma agência. Em 2003, por exemplo, 30 agentes antidrogas foram transferidos do sul do Brooklyn por supostamente gastar US $ 30 mil em horas extras do departamento, informou o "New York Times".